Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CLTCQ00610 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLTCQ00610 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms