Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP5P82980 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP5P82980 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP5P82980 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP5P82980 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP5P82980 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP5P82980 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP5P82980 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP5P82980 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP5P82980 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP5P82980 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP5P82980 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP5P82980 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP5P82980 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP5P82980 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP5P82980 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP5P82980 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP5P82980 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP5P82980 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP5P82980 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP5P82980 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP5P82980 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBP5P82980 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBP5P82980 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP5P82980 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP5P82980 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP5P82980 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP5P82980 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP5P82980 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP5P82980 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP5P82980 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP5P82980 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP5P82980 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP5P82980 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP5P82980 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP5P82980 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP5P82980 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP5P82980 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP5P82980 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP5P82980 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP5P82980 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP5P82980 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP5P82980 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP5P82980 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP5P82980 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP5P82980 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP5P82980 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP5P82980 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP5P82980 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP5P82980 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP5P82980 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP5P82980 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP5P82980 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP5P82980 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP5P82980 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP5P82980 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP5P82980 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP5P82980 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP5P82980 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP5P82980 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP5P82980 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP5P82980 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms