Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX6P78412 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX6P78412 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX6P78412 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX6P78412 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX6P78412 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX6P78412 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX6P78412 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX6P78412 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX6P78412 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX6P78412 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX6P78412 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX6P78412 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX6P78412 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX6P78412 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX6P78412 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX6P78412 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX6P78412 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
IRX6P78412 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
IRX6P78412 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX6P78412 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX6P78412 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX6P78412 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX6P78412 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX6P78412 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX6P78412 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX6P78412 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX6P78412 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX6P78412 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX6P78412 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX6P78412 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX6P78412 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX6P78412 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX6P78412 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX6P78412 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX6P78412 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX6P78412 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX6P78412 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX6P78412 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX6P78412 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX6P78412 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX6P78412 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX6P78412 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX6P78412 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX6P78412 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX6P78412 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX6P78412 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX6P78412 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX6P78412 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX6P78412 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX6P78412 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX6P78412 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms