Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM4P67936 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM4P67936 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM4P67936 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM4P67936 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM4P67936 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM4P67936 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM4P67936 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM4P67936 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM4P67936 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM4P67936 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM4P67936 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM4P67936 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM4P67936 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM4P67936 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM4P67936 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM4P67936 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM4P67936 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM4P67936 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM4P67936 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM4P67936 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM4P67936 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM4P67936 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM4P67936 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM4P67936 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM4P67936 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM4P67936 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM4P67936 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM4P67936 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM4P67936 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM4P67936 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM4P67936 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM4P67936 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM4P67936 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM4P67936 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM4P67936 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM4P67936 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM4P67936 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM4P67936 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM4P67936 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM4P67936 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM4P67936 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM4P67936 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM4P67936 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM4P67936 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM4P67936 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM4P67936 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM4P67936 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM4P67936 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM4P67936 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms