Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL23P62829 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL23P62829 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL23P62829 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL23P62829 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPL23P62829 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL23P62829 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL23P62829 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL23P62829 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL23P62829 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL23P62829 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL23P62829 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL23P62829 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL23P62829 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL23P62829 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms