Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RPS29P62273 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RPS29P62273 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
RPS29P62273 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
RPS29P62273 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RPS29P62273 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RPS29P62273 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RPS29P62273 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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