Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX4P57082 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX4P57082 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX4P57082 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX4P57082 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX4P57082 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX4P57082 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX4P57082 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX4P57082 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX4P57082 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX4P57082 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX4P57082 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX4P57082 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX4P57082 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX4P57082 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX4P57082 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX4P57082 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX4P57082 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX4P57082 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX4P57082 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX4P57082 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX4P57082 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX4P57082 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX4P57082 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX4P57082 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX4P57082 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX4P57082 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX4P57082 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX4P57082 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX4P57082 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX4P57082 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX4P57082 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX4P57082 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX4P57082 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX4P57082 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX4P57082 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX4P57082 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX4P57082 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX4P57082 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX4P57082 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX4P57082 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBX4P57082 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBX4P57082 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms