Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HADHBP55084 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HADHBP55084 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HADHBP55084 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HADHBP55084 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HADHBP55084 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HADHBP55084 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HADHBP55084 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HADHBP55084 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HADHBP55084 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HADHBP55084 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HADHBP55084 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HADHBP55084 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HADHBP55084 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HADHBP55084 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HADHBP55084 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HADHBP55084 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HADHBP55084 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HADHBP55084 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HADHBP55084 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HADHBP55084 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HADHBP55084 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HADHBP55084 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HADHBP55084 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HADHBP55084 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HADHBP55084 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HADHBP55084 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HADHBP55084 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HADHBP55084 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HADHBP55084 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HADHBP55084 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HADHBP55084 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HADHBP55084 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HADHBP55084 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HADHBP55084 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HADHBP55084 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HADHBP55084 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HADHBP55084 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HADHBP55084 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HADHBP55084 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HADHBP55084 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HADHBP55084 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HADHBP55084 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HADHBP55084 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HADHBP55084 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HADHBP55084 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HADHBP55084 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HADHBP55084 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HADHBP55084 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HADHBP55084 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HADHBP55084 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HADHBP55084 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HADHBP55084 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HADHBP55084 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HADHBP55084 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms