Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2KP53803 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms