Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 FKH1YIL131C 1455 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 IOC2YLR095C 2439 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 YBR225WYBR225W 2703 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 FAD1YDL045C 921 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 RPP1AYDL081C 321 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 SLX8YER116C 825 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 COX4YGL187C 468 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 YGL193CYGL193C 312 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 DSD1YGL196W 1287 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 YGR079WYGR079W 1113 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 UTP11YKL099C 753 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 MMM1YLL006W 1281 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 RNA1YMR235C 1224 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 YPT53YNL093W 663 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 YNL181WYNL181W 1224 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 PFA4YOL003C 1137 nt3.49□□□□□ -1.85
SYF2P53277 GCD1YOR260W 1737 nt3.48□□□□□ -1.85
SYF2P53277 VMA22YHR060W 546 nt3.48□□□□□ -1.85
SYF2P53277 IES3YLR052W 753 nt3.48□□□□□ -1.85
SYF2P53277 RSC3YDR303C 2658 nt3.48□□□□□ -1.85
SYF2P53277 NGL3YML118W 1518 nt3.48□□□□□ -1.85
SYF2P53277 ERG5YMR015C 1617 nt3.48□□□□□ -1.85
SYF2P53277 SIR1YKR101W 1965 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 OSH2YDL019C 3852 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 NOG1YPL093W 1944 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 YGL088WYGL088W 366 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 YGL188CYGL188C 174 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 BNA1YJR025C 534 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 ELF1YKL160W 438 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 SNO1YMR095C 675 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 NIS1YNL078W 1224 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 REX4YOL080C 870 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 GPB1YOR371C 2694 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 ARX1YDR101C 1782 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 SPT6YGR116W 4356 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 ALE1YOR175C 1860 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 VPS36YLR417W 1701 nt3.47□□□□□ -1.85
SYF2P53277 YPS7YDR349C 1791 nt3.46□□□□□ -1.86
SYF2P53277 URC2YDR520C 2319 nt3.46□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YDR526CYDR526C 471 nt3.46□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YGL262WYGL262W 528 nt3.46□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YKR075CYKR075C 924 nt3.46□□□□□ -1.86
SYF2P53277 NCE103YNL036W 666 nt3.46□□□□□ -1.86
SYF2P53277 ATG8YBL078C 354 nt3.46□□□□□ -1.86
SYF2P53277 RAD17YOR368W 1206 nt3.46□□□□□ -1.86
SYF2P53277 MCD4YKL165C 2760 nt3.46□□□□□ -1.86
SYF2P53277 RKM3YBR030W 1659 nt3.46□□□□□ -1.86
SYF2P53277 TAF8YML114C 1533 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 BUD5YCR038C 1929 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 HOM2YDR158W 1098 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 MMS21YEL019C 804 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YHR173CYHR173C 339 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 PAM18YLR008C 507 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 UPS2YLR168C 693 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YPT7YML001W 627 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 IBD2YNL164C 1056 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 OSW1YOR255W 837 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 DSE3YOR264W 1293 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 BSD2YBR290W 966 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 HCA4YJL033W 2313 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 RAD54YGL163C 2697 nt3.45□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YRB30YGL164C 1323 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 IOC4YMR044W 1428 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 ALO1YML086C 1581 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 NTA1YJR062C 1374 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 RPS13YDR064W 456 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 SPO73YER046W 432 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YER147C-AYER147C-A 411 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 AIR1YIL079C 1083 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 SRP40YKR092C 1221 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 COQ5YML110C 924 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YGK3YOL128C 1128 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 TEL1YBL088C 8364 nt3.44□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YGL140CYGL140C 3660 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 PRM2YIL037C 1971 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 LTV1YKL143W 1392 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YEL074WYEL074W 339 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YGL074CYGL074C 327 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 RTA1YGR213C 954 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 GVP36YIL041W 981 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 PIR3YKL163W 978 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YAR1YPL239W 603 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 FRM2YCL026C-A 582 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YLR345WYLR345W 1530 nt3.43□□□□□ -1.86
SYF2P53277 SPT16YGL207W 3108 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 CDC45YLR103C 1953 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 ENT5YDR153C 1236 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 MSW1YDR268W 1140 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 BAT2YJR148W 1131 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 SPC34YKR037C 888 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 PSR1YLL010C 1284 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YLR156WYLR156W 345 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YLR159WYLR159W 345 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YLR161WYLR161W 345 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 FLD1YLR404W 858 nt3.42□□□□□ -1.86
SYF2P53277 YOR022CYOR022C 2148 nt3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms