Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
SMARCA4P51532 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
SMARCA4P51532 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
SMARCA4P51532 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA4P51532 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA4P51532 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA4P51532 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA4P51532 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA4P51532 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA4P51532 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA4P51532 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA4P51532 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA4P51532 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA4P51532 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA4P51532 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA4P51532 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA4P51532 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA4P51532 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA4P51532 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA4P51532 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA4P51532 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA4P51532 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA4P51532 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA4P51532 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA4P51532 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA4P51532 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA4P51532 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA4P51532 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA4P51532 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA4P51532 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA4P51532 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA4P51532 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA4P51532 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA4P51532 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA4P51532 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA4P51532 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA4P51532 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA4P51532 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA4P51532 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA4P51532 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC40■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC40■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC40■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms