Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSRP3P50461 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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