Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms