Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP4P49662 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP4P49662 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP4P49662 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP4P49662 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP4P49662 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP4P49662 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP4P49662 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP4P49662 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP4P49662 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP4P49662 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP4P49662 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP4P49662 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP4P49662 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP4P49662 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP4P49662 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP4P49662 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP4P49662 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP4P49662 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP4P49662 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP4P49662 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP4P49662 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP4P49662 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP4P49662 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP4P49662 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms