Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FNTAP49354 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNTAP49354 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNTAP49354 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTAP49354 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTAP49354 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTAP49354 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTAP49354 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTAP49354 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTAP49354 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTAP49354 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTAP49354 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNTAP49354 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTAP49354 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTAP49354 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTAP49354 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTAP49354 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTAP49354 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTAP49354 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTAP49354 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTAP49354 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTAP49354 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNTAP49354 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTAP49354 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTAP49354 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTAP49354 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTAP49354 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTAP49354 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTAP49354 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTAP49354 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTAP49354 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTAP49354 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNTAP49354 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FNTAP49354 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FNTAP49354 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FNTAP49354 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNTAP49354 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNTAP49354 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms