Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6CP48668 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms