Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP2P46087 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP2P46087 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP2P46087 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP2P46087 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP2P46087 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP2P46087 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP2P46087 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP2P46087 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP2P46087 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP2P46087 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP2P46087 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP2P46087 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP2P46087 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP2P46087 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP2P46087 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP2P46087 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP2P46087 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP2P46087 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP2P46087 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP2P46087 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP2P46087 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP2P46087 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP2P46087 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP2P46087 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP2P46087 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP2P46087 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP2P46087 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP2P46087 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP2P46087 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP2P46087 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP2P46087 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP2P46087 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms