Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNT3P45378 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT3P45378 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms