Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGIRP43119 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGIRP43119 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms