Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELK3P41970 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELK3P41970 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELK3P41970 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELK3P41970 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELK3P41970 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELK3P41970 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ELK3P41970 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK3P41970 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK3P41970 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK3P41970 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK3P41970 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK3P41970 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK3P41970 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK3P41970 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK3P41970 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELK3P41970 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK3P41970 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK3P41970 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK3P41970 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK3P41970 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK3P41970 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK3P41970 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK3P41970 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK3P41970 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK3P41970 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELK3P41970 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELK3P41970 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELK3P41970 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK3P41970 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK3P41970 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK3P41970 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK3P41970 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK3P41970 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK3P41970 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK3P41970 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK3P41970 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK3P41970 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELK3P41970 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELK3P41970 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELK3P41970 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELK3P41970 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELK3P41970 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELK3P41970 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELK3P41970 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms