Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTRLP40313 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRLP40313 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRLP40313 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRLP40313 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRLP40313 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRLP40313 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRLP40313 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRLP40313 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTRLP40313 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRLP40313 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRLP40313 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRLP40313 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRLP40313 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRLP40313 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRLP40313 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRLP40313 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRLP40313 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTRLP40313 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRLP40313 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRLP40313 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRLP40313 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRLP40313 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRLP40313 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRLP40313 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTRLP40313 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CTRLP40313 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTRLP40313 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTRLP40313 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTRLP40313 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTRLP40313 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTRLP40313 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTRLP40313 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTRLP40313 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTRLP40313 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTRLP40313 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTRLP40313 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTRLP40313 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTRLP40313 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTRLP40313 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms