Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB2P35606 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB2P35606 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB2P35606 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB2P35606 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB2P35606 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COPB2P35606 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPB2P35606 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB2P35606 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB2P35606 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB2P35606 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB2P35606 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPB2P35606 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPB2P35606 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPB2P35606 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB2P35606 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB2P35606 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB2P35606 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB2P35606 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB2P35606 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPB2P35606 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB2P35606 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB2P35606 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB2P35606 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB2P35606 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB2P35606 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB2P35606 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB2P35606 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB2P35606 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPB2P35606 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPB2P35606 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPB2P35606 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COPB2P35606 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB2P35606 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB2P35606 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB2P35606 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB2P35606 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB2P35606 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPB2P35606 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COPB2P35606 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms