Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SCN4AP35499 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCN4AP35499 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN4AP35499 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms