Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC1P33527 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms