Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2C19P33261 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2C19P33261 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms