Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP1P32455 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP1P32455 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP1P32455 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP1P32455 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP1P32455 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP1P32455 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP1P32455 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP1P32455 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP1P32455 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP1P32455 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP1P32455 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP1P32455 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP1P32455 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP1P32455 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms