Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OTX2P32243 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTX2P32243 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX2P32243 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX2P32243 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX2P32243 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX2P32243 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX2P32243 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX2P32243 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX2P32243 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX2P32243 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX2P32243 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OTX2P32243 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OTX2P32243 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OTX2P32243 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OTX2P32243 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
OTX2P32243 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX2P32243 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX2P32243 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX2P32243 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX2P32243 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX2P32243 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX2P32243 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX2P32243 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX2P32243 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX2P32243 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms