Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CLIP1P30622 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLIP1P30622 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms