Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TM4SF1P30408 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms