Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALDH4A1P30038 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms