Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBL1P28749 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBL1P28749 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RBL1P28749 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBL1P28749 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBL1P28749 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBL1P28749 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBL1P28749 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBL1P28749 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms