Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBB3P26998 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBB3P26998 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms