Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR2AP24928 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms