Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms