Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ME2P23368 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME2P23368 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME2P23368 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME2P23368 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME2P23368 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME2P23368 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ME2P23368 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ME2P23368 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ME2P23368 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME2P23368 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME2P23368 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME2P23368 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME2P23368 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME2P23368 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME2P23368 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME2P23368 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ME2P23368 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME2P23368 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME2P23368 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME2P23368 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME2P23368 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME2P23368 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME2P23368 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME2P23368 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME2P23368 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME2P23368 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME2P23368 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME2P23368 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME2P23368 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME2P23368 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ME2P23368 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME2P23368 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME2P23368 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME2P23368 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME2P23368 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME2P23368 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME2P23368 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME2P23368 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME2P23368 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME2P23368 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME2P23368 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms