Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRHP20396 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRHP20396 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRHP20396 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRHP20396 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRHP20396 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRHP20396 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRHP20396 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRHP20396 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRHP20396 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRHP20396 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRHP20396 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRHP20396 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRHP20396 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRHP20396 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRHP20396 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRHP20396 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRHP20396 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRHP20396 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRHP20396 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TRHP20396 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRHP20396 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRHP20396 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRHP20396 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
TRHP20396 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRHP20396 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRHP20396 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRHP20396 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRHP20396 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
TRHP20396 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
TRHP20396 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
TRHP20396 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRHP20396 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRHP20396 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRHP20396 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRHP20396 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRHP20396 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRHP20396 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRHP20396 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRHP20396 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRHP20396 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TRHP20396 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRHP20396 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRHP20396 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRHP20396 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRHP20396 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRHP20396 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRHP20396 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRHP20396 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRHP20396 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRHP20396 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRHP20396 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TRHP20396 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRHP20396 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRHP20396 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRHP20396 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRHP20396 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRHP20396 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRHP20396 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRHP20396 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRHP20396 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRHP20396 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRHP20396 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRHP20396 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRHP20396 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRHP20396 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRHP20396 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRHP20396 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRHP20396 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRHP20396 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRHP20396 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRHP20396 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRHP20396 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRHP20396 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRHP20396 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRHP20396 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRHP20396 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRHP20396 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRHP20396 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRHP20396 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRHP20396 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRHP20396 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRHP20396 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRHP20396 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
TRHP20396 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
TRHP20396 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRHP20396 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRHP20396 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRHP20396 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms