Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2EP19388 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2EP19388 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms