Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6GP18545 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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