Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB5P18084 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms