Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GM2AP17900 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GM2AP17900 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GM2AP17900 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GM2AP17900 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GM2AP17900 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GM2AP17900 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GM2AP17900 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GM2AP17900 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GM2AP17900 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GM2AP17900 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GM2AP17900 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GM2AP17900 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GM2AP17900 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GM2AP17900 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GM2AP17900 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GM2AP17900 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GM2AP17900 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GM2AP17900 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GM2AP17900 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GM2AP17900 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms