Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCFC2P16383 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms