Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD44P16070 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD44P16070 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD44P16070 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD44P16070 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD44P16070 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD44P16070 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD44P16070 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD44P16070 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD44P16070 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD44P16070 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD44P16070 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD44P16070 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD44P16070 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD44P16070 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD44P16070 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD44P16070 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD44P16070 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD44P16070 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD44P16070 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD44P16070 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD44P16070 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD44P16070 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD44P16070 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD44P16070 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD44P16070 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD44P16070 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD44P16070 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD44P16070 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD44P16070 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD44P16070 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD44P16070 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD44P16070 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD44P16070 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD44P16070 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD44P16070 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD44P16070 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD44P16070 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD44P16070 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CD44P16070 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD44P16070 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD44P16070 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD44P16070 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD44P16070 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD44P16070 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD44P16070 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD44P16070 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD44P16070 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CD44P16070 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CD44P16070 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CD44P16070 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CD44P16070 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD44P16070 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD44P16070 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD44P16070 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD44P16070 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD44P16070 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD44P16070 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD44P16070 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD44P16070 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD44P16070 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD44P16070 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD44P16070 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD44P16070 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD44P16070 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD44P16070 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD44P16070 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD44P16070 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD44P16070 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD44P16070 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD44P16070 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD44P16070 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD44P16070 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD44P16070 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD44P16070 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD44P16070 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD44P16070 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD44P16070 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD44P16070 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CD44P16070 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD44P16070 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD44P16070 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD44P16070 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CD44P16070 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD44P16070 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD44P16070 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD44P16070 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CD44P16070 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD44P16070 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms