Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG1P15918 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG1P15918 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG1P15918 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG1P15918 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG1P15918 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG1P15918 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG1P15918 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG1P15918 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG1P15918 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAG1P15918 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAG1P15918 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAG1P15918 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAG1P15918 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAG1P15918 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAG1P15918 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAG1P15918 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAG1P15918 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAG1P15918 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAG1P15918 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAG1P15918 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAG1P15918 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAG1P15918 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAG1P15918 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAG1P15918 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAG1P15918 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAG1P15918 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAG1P15918 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG1P15918 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAG1P15918 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAG1P15918 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAG1P15918 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAG1P15918 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAG1P15918 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAG1P15918 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAG1P15918 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG1P15918 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG1P15918 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG1P15918 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG1P15918 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG1P15918 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG1P15918 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms