Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CFTRP13569 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFTRP13569 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFTRP13569 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFTRP13569 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFTRP13569 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFTRP13569 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFTRP13569 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFTRP13569 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFTRP13569 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
CFTRP13569 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFTRP13569 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CFTRP13569 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CFTRP13569 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CFTRP13569 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CFTRP13569 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CFTRP13569 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
CFTRP13569 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CFTRP13569 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CFTRP13569 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CFTRP13569 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFTRP13569 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFTRP13569 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
CFTRP13569 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFTRP13569 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFTRP13569 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFTRP13569 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFTRP13569 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CFTRP13569 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CFTRP13569 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CFTRP13569 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CFTRP13569 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFTRP13569 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CFTRP13569 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CFTRP13569 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CFTRP13569 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CFTRP13569 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CFTRP13569 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CFTRP13569 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CFTRP13569 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CFTRP13569 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CFTRP13569 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CFTRP13569 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CFTRP13569 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CFTRP13569 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFTRP13569 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFTRP13569 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFTRP13569 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFTRP13569 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFTRP13569 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CFTRP13569 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CFTRP13569 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CFTRP13569 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CFTRP13569 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CFTRP13569 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CFTRP13569 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CFTRP13569 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CFTRP13569 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CFTRP13569 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CFTRP13569 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CFTRP13569 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CFTRP13569 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFTRP13569 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CFTRP13569 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CFTRP13569 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CFTRP13569 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CFTRP13569 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CFTRP13569 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CFTRP13569 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms