Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG2P13521 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG2P13521 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG2P13521 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG2P13521 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG2P13521 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG2P13521 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG2P13521 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG2P13521 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG2P13521 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG2P13521 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG2P13521 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG2P13521 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG2P13521 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG2P13521 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG2P13521 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG2P13521 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG2P13521 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCG2P13521 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCG2P13521 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCG2P13521 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCG2P13521 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCG2P13521 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG2P13521 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG2P13521 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG2P13521 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG2P13521 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG2P13521 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG2P13521 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG2P13521 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG2P13521 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms