Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA4P12838 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA4P12838 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms