Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN1P12814 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms