Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL11A1P12107 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL11A1P12107 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL11A1P12107 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms