Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms