Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2AP11388 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOP2AP11388 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
TOP2AP11388 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOP2AP11388 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms